RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	FKBP6	O75344	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	NDUFA7	O95182	113 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	HMGN1	P05114	100 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	FLOT2	Q14254	428 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TAF9	Q16594	264 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM210	A6NLX4	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	DYRK2	Q92630	601 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	GYG2	O15488	501 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ANXA8	P13928	327 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	NDUFB7	P17568	137 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	GABRA2	P47869	451 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	SNCB	Q16143	134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TEAD3	Q99594	435 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	CITED1	Q99966	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	NPFF	O15130	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	PRKY	O43930	277 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	FAH	P16930	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	GLRA1	P23415	457 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	DAP	P51397	102 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	DEFA6	Q01524	100 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	POMP	Q9Y244	141 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-208	ENST00000392449		A0A1B0GUS0	222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449		A0A1W2PQ09	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	SIGLEC5	O15389	551 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PSG2	P11465	335 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	SAA4	P35542	130 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MAP2K3	P46734	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CRISP1	P54107	249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449		A0A0U1RQV5	110 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	PAX6	P26367	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-208	ENST00000392449	EPHA2	P29317	976 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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