RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FAM206AQ9NX38 181 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 COPS3Q9UNS2 423 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DYNC1I1O14576 645 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GYG2O15488 501 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 E2F6O75461 281 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV1-69P01742 117 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TFF1P04155 84 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GNALP38405 381 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CRISP1P54107 249 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ARF6P62330 175 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 EFNB1P98172 346 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 IL5RAQ01344 420 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ROM1Q03395 351 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SPATA24Q86W54 205 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 Q8N7P7 452 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ST8SIA4Q92187 359 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 NRBF2Q96F24 287 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TEAD3Q99594 435 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PKP2Q99959 881 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CHIAQ9BZP6 476 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 NIPAL2Q9H841 368 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 NOX4Q9NPH5 578 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0U1RQV5 110 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM210A6NLX4 147 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 POM121CA8CG34 1229 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 M0R129 80 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PRKYO43930 277 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 EPHA2P29317 976 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PDCD1Q15116 288 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 METTL11BQ5VVY1 283 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM86BQ8N661 226 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LHX4Q969G2 390 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GAFA1Q96PS6 74 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MICU1Q9BPX6 476 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 YY1AP1Q9H869 796 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 KPTNQ9Y664 436 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0U1RQK1 487 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ACOD1A6NK06 481 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PSMD9O00233 223 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GSC2O15499 205 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 WIPF1O43516 503 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RHBDL1O75783 438 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OMGP23515 440 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 BNIP1Q12981 228 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SNCBQ16143 134 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SNAPC1Q16533 368 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DGUOKQ16854 277 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CDONQ4KMG0 1287 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DEGS2Q6QHC5 323 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FTMTQ8N4E7 242 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PIGCQ92535 297 aa9.84□□□□□ -0.83
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