RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOB3CQ70IA8 216 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLK3Q9H4B4 646 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM100Q9NV29 134 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR160Q9UJ42 338 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 V9GY05 133 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLSCR5A0PG75 271 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 LILRA1O75019 489 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN1O95832 211 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 HCKP08631 526 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD37P11049 281 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRF1P14222 555 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CA6P23280 308 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 FUT6P51993 359 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDI2Q5TDH0 399 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRP11Q86VZ4 500 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYT3Q9BQG1 590 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFPP27918 469 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 RANBP1P43487 201 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBP2P50120 134 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMP15P51511 669 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFNB3Q15768 340 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGUOKQ16854 277 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPERTQ8NA61 448 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITPKCQ96DU7 683 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 BORCS8Q96FH0 119 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 GFI1Q99684 422 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNA1CQ13936 2221 aa14.46□□□□□ -0.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0G2JK05 382 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5B21A6NL26 309 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFITM5A6NNB3 132 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 B9A039 149 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 AIPO00170 330 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10A3P58181 314 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MZT1Q08AG7 82 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8G1Q15617 311 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8S1Q8NH09 359 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEUROG1Q92886 237 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXW5Q969U6 566 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MICU1Q9BPX6 476 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM30A4D0T7 59 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM221AA4D161 298 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCR1O76036 304 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX6B1P14854 86 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP1B3P54709 279 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTCP1P56278 107 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 KISS1Q15726 138 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZR03 302 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYPD6Q86Y78 171 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 AP3S1Q92572 193 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIRC2Q96SL1 478 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRI1Q9BV20 369 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.3 ms