RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996		A6NHS1	94 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	LILRA1	O75019	489 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	RAF1	P04049	648 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	COX6B1	P14854	86 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	GNAL	P38405	381 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	DDOST	P39656	456 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	VBP1	P61758	197 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	BATF3	Q9NR55	127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	TENM4	Q6N022	2769 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996		A0A1W2PPR1	153 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996		H3BMQ9	156 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CST4	P01036	141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	OR4A8	P0C604	315 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	MYL9	P24844	172 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	KRT74	Q7RTS7	529 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	FTMT	Q8N4E7	242 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PP6455	Q8WZ26	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	KCTD7	Q96MP8	289 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	GPR173	Q9NS66	373 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996		A0A1W2PPW3	197 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	FAM221A	A4D161	298 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SULT1B1	O43704	296 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	GMDS	O60547	372 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	NRAS	P01111	189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SRM	P19623	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SELENOV	P59797	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PPP3R1	P63098	170 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PRDX4	Q13162	271 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	UBE2V2	Q15819	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF529	Q6P280	563 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996		Q6ZR03	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	NDNF	Q8TB73	568 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PIGC	Q92535	297 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PIGT	Q969N2	578 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	VSTM5	A8MXK1	200 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	HS3ST1	O14792	307 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SLC22A1	O15245	554 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	MAS1	P04201	325 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	ATF1	P18846	271 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	RAB3A	P20336	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	CA6	P23280	308 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SDC2	P34741	201 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SERPINF1	P36955	418 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SERPINB10	P48595	397 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	MTNR1B	P49286	362 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	MMP15	P51511	669 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF13-208	ENST00000467996	SPCS2	Q15005	226 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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