RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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SPTAN1-232ENST00000636483 CEP135Q66GS9 1140 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 FOXR1Q6PIV2 292 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 TPTE2Q6XPS3 522 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 HS2ST1Q7LGA3 356 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 CCNJLQ8IV13 435 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF654Q8IZM8 581 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 TRPM4Q8TD43 1214 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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SPTAN1-232ENST00000636483 C8orf37Q96NL8 207 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.53□□□□□ -1.84
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SPTAN1-232ENST00000636483 MUC3BQ9H195 1237 aa3.53□□□□□ -1.84
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SPTAN1-232ENST00000636483 ABCB6Q9NP58 842 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 KBTBD4Q9NVX7 518 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 PHF24Q9UPV7 400 aa3.53□□□□□ -1.84
SPTAN1-232ENST00000636483 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.53□□□□□ -1.84
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SPTAN1-232ENST00000636483 PAGE1O75459 146 aa3.52□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SOX18P35713 384 aa3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ITGAEP38570 1179 aa3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ST13P50502 369 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 NRLP54845 237 aa3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 FAAP100Q0VG06 881 aa3.52□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 FAM182BQ5T319 152 aa3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM35AQ86V20 835 aa3.52□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 NUDT8Q8WV74 236 aa3.52□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SEC31BQ9NQW1 1179 aa3.52□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 CELA3AP09093 270 aa3.51□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.51□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 SIN3BO75182 1162 aa3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ITPKAP23677 461 aa3.5□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 RASIP1Q5U651 963 aa3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 VN1R5Q7Z5H4 357 aa3.5□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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SPTAN1-232ENST00000636483 SPON2Q9BUD6 331 aa3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 GGA1Q9UJY5 639 aa3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 NAGPAQ9UK23 515 aa3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa3.5□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP2B1P20020 1258 aa3.49□□□□□ -1.85
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