RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.54■■□□□ 1.68
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NELFE-212ENST00000492539 SLC10A3P09131 477 aa25.53■■□□□ 1.68
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NELFE-212ENST00000492539 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.53■■□□□ 1.68
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NELFE-212ENST00000492539 DACT2Q5SW24 774 aa25.49■■□□□ 1.67
NELFE-212ENST00000492539 CASP7P55210 303 aa25.48■■□□□ 1.67
NELFE-212ENST00000492539 GCKRQ14397 625 aa25.48■■□□□ 1.67
NELFE-212ENST00000492539 RNF186Q9NXI6 227 aa25.48■■□□□ 1.67
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NELFE-212ENST00000492539 COA1Q9GZY4 146 aa25.47■■□□□ 1.67
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NELFE-212ENST00000492539 A0A1B0GUL6 1792 aa25.46■■□□□ 1.67
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NELFE-212ENST00000492539 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.46■■□□□ 1.67
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NELFE-212ENST00000492539 MXD3Q9BW11 206 aa25.46■■□□□ 1.67
NELFE-212ENST00000492539 CSF1RP07333 972 aa25.45■■□□□ 1.66
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NELFE-212ENST00000492539 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.44■■□□□ 1.66
NELFE-212ENST00000492539 TRPA1O75762 1119 aa25.44■■□□□ 1.66
NELFE-212ENST00000492539 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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NELFE-212ENST00000492539 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.41■■□□□ 1.66
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NELFE-212ENST00000492539 MRS2Q9HD23 443 aa25.36■■□□□ 1.65
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NELFE-212ENST00000492539 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.35■■□□□ 1.65
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NELFE-212ENST00000492539 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.35■■□□□ 1.65
NELFE-212ENST00000492539 NF2P35240 595 aa25.34■■□□□ 1.65
NELFE-212ENST00000492539 KCNJ4P48050 445 aa25.34■■□□□ 1.65
NELFE-212ENST00000492539 BEND3Q5T5X7 828 aa25.34■■□□□ 1.65
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NELFE-212ENST00000492539 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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NELFE-212ENST00000492539 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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NELFE-212ENST00000492539 IL1R1P14778 569 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-212ENST00000492539 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NELFE-212ENST00000492539 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NELFE-212ENST00000492539 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.28■■□□□ 1.64
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NELFE-212ENST00000492539 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-212ENST00000492539 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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NELFE-212ENST00000492539 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-212ENST00000492539 GRM8O00222 908 aa25.26■■□□□ 1.63
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