RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469403.1

AGRN-205, Transcript of agrin, human

TSL 3

Gene AGRN, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AGRN-205	ENST00000469403	SBF1	O95248	1867 aa		32.59	■■■□□ 2.81
AGRN-205	ENST00000469403	RASSF7	Q02833	373 aa		32.58	■■■□□ 2.81
AGRN-205	ENST00000469403	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
AGRN-205	ENST00000469403	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
AGRN-205	ENST00000469403	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
AGRN-205	ENST00000469403	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	TIMM10	P62072	90 aa		32.57	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		32.57	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.56	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	KLRK1	P26718	216 aa		32.55	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	PRELP	P51888	382 aa		32.55	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	NUCB1	Q02818	461 aa		32.55	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.55	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		32.54	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.54	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	LMNB1	P20700	586 aa		32.54	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		32.54	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	ZBTB22	O15209	634 aa		32.53	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	AOC3	Q16853	763 aa		32.53	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.53	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	AACS	Q86V21	672 aa		32.53	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.53	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		32.52	■■■□□ 2.8
AGRN-205	ENST00000469403	COL4A5	P29400	1685 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	RIMBP2	O15034	1052 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	ADORA1	P30542	326 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	COA1	Q9GZY4	146 aa		32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		32.5	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	GYG1	P46976	350 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		32.49	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	IL1R1	P14778	569 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	BCAM	P50895	628 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	PODN	Q7Z5L7	613 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	CCDC102B	Q68D86	513 aa		32.46	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.46	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.45	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.45	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
AGRN-205	ENST00000469403	PHKA1	P46020	1223 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	DOK7	Q18PE1	504 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	LNPK	Q9C0E8	428 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		32.44	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403		G3V3G9	751 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	ECE2	O60344	883 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	CHD4	Q14839	1912 aa		32.43	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	SEMA3E	O15041	775 aa		32.42	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		32.42	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	PSME4	Q14997	1843 aa		32.42	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	FZD9	O00144	591 aa		32.41	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.41	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	SCN9A	Q15858	1988 aa		32.4	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.4	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.39	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32.39	■■■□□ 2.78
AGRN-205	ENST00000469403	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	GPATCH3	Q96I76	525 aa		32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	STAP2	Q9UGK3	403 aa		32.38	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	BCL11A	Q9H165	835 aa		32.37	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		32.36	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	ATP5J	P18859	108 aa		32.36	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	MX1	P20591	662 aa		32.36	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	RASGRF1	Q13972	1273 aa		32.36	■■■□□ 2.77
AGRN-205	ENST00000469403	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		32.36	■■■□□ 2.77

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