RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 ERBB4Q15303 1308 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 GHRHP01286 108 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ADH7P40394 386 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 FCGRTP55899 365 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ATP11AP98196 1134 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 FAM35AQ86V20 835 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 NXPE3Q969Y0 559 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 RBSNQ9H1K0 784 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 METTL12A8MUP2 240 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 CPB1P15086 417 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ITPKAP23677 461 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 GRIA4P48058 902 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 TREML4Q6UXN2 200 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 GGA1Q9UJY5 639 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 A0A096LPE4 126 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PPZ6 126 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 WFS1O76024 890 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 KRT76Q01546 638 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 PERM1Q5SV97 790 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ELOA3Q8NG57 546 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 SLC16A10Q8TF71 515 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 IRF7Q92985 503 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 PLD4Q96BZ4 506 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 C8orf37Q96NL8 207 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 CEP135Q66GS9 1140 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-205ENST00000391970 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF576Q9H609 170 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ADAMTS2O95450 1211 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 EPXP11678 715 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K10Q02779 954 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 TTC9Q92623 222 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ACDQ96AP0 544 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 MUC3BQ9H195 1237 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 GGT7Q9UJ14 662 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 SOX13Q9UN79 622 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO24O75426 580 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 PTPRAP18433 802 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ALAS2P22557 587 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 FAAP100Q0VG06 881 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF394Q53GI3 561 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-205ENST00000391970 SV2BQ7L1I2 683 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-205ENST00000391970 ADAM19Q9H013 955 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-205ENST00000391970 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-205ENST00000391970 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-205ENST00000391970 CELA3AP09093 270 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-205ENST00000391970 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-205ENST00000391970 GRIK5Q16478 980 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-205ENST00000391970 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-205ENST00000391970 KANK3Q6NY19 840 aa5.02□□□□□ -1.61
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