RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.14■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.14■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD7Q92527 254 aa20.14■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.14■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 STX1AQ16623 288 aa20.13■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 CEP135Q66GS9 1140 aa20.13■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.13■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PFKFB2O60825 505 aa20.13■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 LRRC24Q50LG9 513 aa20.13■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.13■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC69A6NI79 296 aa20.12■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 E7EWF7 191 aa20.12■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 SMTNL1A8MU46 457 aa20.12■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PHKG2P15735 406 aa20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ERBB3P21860 1342 aa20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 JCADQ9P266 1359 aa20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 NCAPD2Q15021 1401 aa20.1■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 WASHC4Q2M389 1173 aa20.09■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.09■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 M0R2C6 588 aa20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 SMC2O95347 1197 aa20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 PTPN14Q15678 1187 aa20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 ELF2Q15723 593 aa20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 CLIC4Q9Y696 253 aa20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 NDUFA8P51970 172 aa20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.08■□□□□ 0.81
SEPHS1-201ENST00000327347 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.08■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 MAST3O60307 1309 aa20.08■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CABP4P57796 275 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 STK38Q15208 465 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CYP27B1O15528 508 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ANO10Q9NW15 660 aa20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 A1BGP04217 495 aa20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.06■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 PI16Q6UXB8 463 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 OSBP2Q969R2 916 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 A0A1B0GUL7 405 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 RXRAP19793 462 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 FOXO4P98177 505 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CCZ1BP86790 482 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.05■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 TMC6Q7Z403 805 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 IFNKQ9P0W0 207 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 NBPF26B4DH59 902 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 CTAGE5O15320 804 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ADORA1P30542 326 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 NBPF14Q5TI25 921 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 NBPF15Q8N660 670 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 EPC1Q9H2F5 836 aa20.04■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.03■□□□□ 0.8
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms