RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 UTYO14607 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 KAZALD1Q96I82 304 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 SUCLG2Q96I99 432 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 USP44Q9H0E7 712 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 CHRNDQ07001 517 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 MEIS3Q99687 375 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 H7C1D1 291 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 PODNQ7Z5L7 613 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 EGFRP00533 1210 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 GNAI3P08754 354 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 KLRK1P26718 216 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 ZNF609O15014 1411 aa22.78■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 TRAF5O00463 557 aa22.77■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTX4-201ENST00000293922 SNAP23O00161 211 aa22.76■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 CNTNAP1P78357 1384 aa22.76■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 USP17L3A6NCW0 530 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 USP17L4A6NCW7 530 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 TAF5LO75529 589 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 GMLQ99445 158 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 COA1Q9GZY4 146 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 PSME4Q14997 1843 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.75■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 KCNJ4P48050 445 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.74■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 GNAI2P04899 355 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 CST9Q5W186 159 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.73■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GUL6 1792 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 DACT2Q5SW24 774 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 RASSF10A6NK89 507 aa22.71■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.71■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.71■■□□□ 1.23
PTX4-201ENST00000293922 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 MXD3Q9BW11 206 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 USP17L8P0C7I0 530 aa22.69■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 VEGFBP49765 207 aa22.69■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 USP48Q86UV5 1035 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 FBXW7Q969H0 707 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 CD209Q9NNX6 404 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.68■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 CEP85Q6P2H3 762 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 DLK2Q6UY11 383 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.66■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 GTF2IP78347 998 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 GGA3Q9NZ52 723 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 IL1R1P14778 569 aa22.65■■□□□ 1.22
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