RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC102BQ68D86 513 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 M0R2C6 588 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 TRAK2O60296 914 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 PHKA1P46020 1223 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 OSBP2Q969R2 916 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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RABGGTA-201ENST00000216840 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT32Q14532 448 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 C4AP0C0L4 1744 aa20.59■□□□□ 0.89
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RABGGTA-201ENST00000216840 CYP21A2P08686 494 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC5A1P13866 664 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1B0GUL6 1792 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMA4Q16363 1823 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-201ENST00000216840 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.58■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 SNAP23O00161 211 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 BRD1O95696 1058 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 PTMSP20962 102 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 APPBP2Q92624 585 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 SETDB2Q96T68 719 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 NYXQ9GZU5 481 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 CHRNDQ07001 517 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 WASHC4Q2M389 1173 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 NEK1Q96PY6 1258 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 ME3Q16798 604 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.885e-6■■■■■ 34.6
RABGGTA-201ENST00000216840 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD1Q15327 319 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.54■□□□□ 0.88
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RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 DOCK2Q92608 1830 aa20.54■□□□□ 0.88
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RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXP2O15409 715 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A0G2JLW4 131 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 MCTP1Q6DN14 999 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 SPATA5Q8NB90 893 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-201ENST00000216840 RFC4P35249 363 aa20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 RASGRF1Q13972 1273 aa20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 PHF14O94880 888 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 UBE3CQ15386 1083 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 BCAMP50895 628 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 NECAB1Q8N987 351 aa20.5■□□□□ 0.87
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RABGGTA-201ENST00000216840 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 E7EWF7 191 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE6AP16499 860 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-201ENST00000216840 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.49■□□□□ 0.87
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