RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 OR51A7Q8NH64 312 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 OR10A6Q8NH74 314 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 LZICQ8WZA0 190 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 Q96M85 177 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SYT4Q9H2B2 425 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 A0A1W2PPE2 198 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 A0A1W2PR64 198 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 A0A1W2PRV1 198 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 MEGF11A6BM72 1044 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 A6NLC8 198 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 M0R135 149 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 F2RL2O00254 374 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 XRCC2O43543 280 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 PEX14O75381 377 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 KRT34O76011 436 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 LCATP04180 440 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SLC6A1P30531 599 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 GGT2P36268 569 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 DYNLT3P51808 116 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SELENOWP63302 87 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CD83Q01151 205 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 NFYCQ13952 458 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 PCK2Q16822 640 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 WDR38Q5JTN6 314 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 STUMQ69YW2 141 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 NRMQ8IXM6 262 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 FTMTQ8N4E7 242 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SPSB4Q96A44 273 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF799Q96GE5 643 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 PITX2Q99697 317 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 NUAK2Q9H093 628 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 TOR3AQ9H497 397 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SP140LQ9H930 580 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF702PQ9H963 129 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 GGT3PA6NGU5 568 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 F5H5K5 113 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 H7C1C5 153 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ARPC3O15145 178 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 IFNW1P05000 195 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CD28P10747 220 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 NOS3P29474 1203 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 LCN6P62502 163 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 RFX4Q33E94 735 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 RRM2BQ7LG56 351 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CALHM1Q8IU99 346 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 OR8S1Q8NH09 359 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 CD300AQ9UGN4 299 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 TCF19Q9Y242 345 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-215ENST00000592911 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms