RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559247.1

SEMA4B-209, Transcript of semaphorin 4B, human

TSL 2

Gene SEMA4B, Length 850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4B-209	ENST00000559247		B2RBV5	119 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	FCN3	O75636	299 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	HSD11B1	P28845	292 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	MNAT1	P51948	309 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	MICA	Q29983	383 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	CD276	Q5ZPR3	534 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	FAM57B	Q71RH2	274 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	ST8SIA4	Q92187	359 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	AMELY	Q99218	206 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	P2RY10	O00398	339 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	TOX4	O94842	621 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	MMP9	P14780	707 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	SLC15A1	P46059	708 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	FAM3A	P98173	230 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	MZT1	Q08AG7	82 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	TEX30	Q5JUR7	227 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	LRRC29	Q8WV35	223 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	WDFY2	Q96P53	400 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	INTS14	Q96SY0	518 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SEMA4B-209	ENST00000559247	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247		H3BN98	237 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	DVL1	O14640	695 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	KCNAB3	O43448	404 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	MELTF	P08582	738 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	GSTT1	P30711	240 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	DDOST	P39656	456 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	BLVRA	P53004	296 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	RAG2	P55895	527 aa		11.39	□□□□□ -0.59
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SEMA4B-209	ENST00000559247	MS4A2	Q01362	244 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	KLHL12	Q53G59	568 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
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SEMA4B-209	ENST00000559247	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	LHX4	Q969G2	390 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	NDUFA2	O43678	99 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	SELENOF	O60613	162 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	POU1F1	P28069	291 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	GRK5	P34947	590 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	GNAL	P38405	381 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	OPRL1	P41146	370 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	ARF6	P62330	175 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	WDR82	Q6UXN9	313 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SEMA4B-209	ENST00000559247	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.38	□□□□□ -0.59

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