RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	CHP2	O43745	196 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	DPM1	O60762	260 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	BANF1	O75531	89 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SC5D	O75845	299 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SULT1C4	O75897	302 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	RHOC	P08134	193 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	COX5B	P10606	129 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	FOLR1	P15328	257 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ARR3	P36575	388 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CDKN2C	P42773	168 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC25A1	P53007	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CSNK1G2	P78368	415 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP24A1	Q07973	514 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	OR7A5	Q15622	319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TNXA	Q16473	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ZBED5	Q49AG3	693 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	EOGT	Q5NDL2	527 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	UNC93A	Q86WB7	457 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ING5	Q8WYH8	240 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	RASL10A	Q92737	203 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SGTB	Q96EQ0	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SERPINI1	Q99574	410 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	MED10	Q9BTT4	135 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	MND1	Q9BWT6	205 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	MRO	Q9BYG7	248 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006		Q9H3A6	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	IFT46	Q9NQC8	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	VSIG4	Q9Y279	399 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ASF1A	Q9Y294	204 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ISPD	A4D126	451 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	HACD1	B0YJ81	288 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC31A2	O15432	143 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ZMPSTE24	O75844	475 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SNAPC5	O75971	98 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	AIFM1	O95831	613 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	IFNG	P01579	166 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SEMG1	P04279	462 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CDK1	P06493	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SERPINA6	P08185	405 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	FBP1	P09467	338 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ZP3	P21754	424 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TEAD1	P28347	426 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	FMO3	P31513	532 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	UGT2B10	P36537	528 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SLCO1A2	P46721	670 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	OR2B6	P58173	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC35B1	P78383	322 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	MS4A2	Q01362	244 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	DEFA6	Q01524	100 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TSPAN31	Q12999	210 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	UNC119	Q13432	240 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	TMED2	Q15363	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT10-208	ENST00000463006	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms