RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SEH1L	Q96EE3	360 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CSNK2B	P67870	215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM3A	P98173	230 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FEV	Q99581	238 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CMC2	Q9NRP2	79 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	XRCC2	O43543	280 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	IFNG	P01579	166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MMP9	P14780	707 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF3	P17036	446 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	HSD11B1	P28845	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MNAT1	P51948	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF879	B4DU55	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449		H3BN98	237 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TOX4	O94842	621 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	LHB	P01229	141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GSTT1	P30711	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	NPY4R	P50391	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	DVL1	O14640	695 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TFF1	P04155	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	POU1F1	P28069	291 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC15A1	P46059	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GMFB	P60983	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	IL13RA1	P78552	427 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CCL13	Q99616	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	KCNAB3	O43448	404 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	SELENOF	O60613	162 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CST1	P01037	141 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	RAP2A	P10114	183 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GRK5	P34947	590 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	OPRL1	P41146	370 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	GSK3A	P49840	483 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	ARF6	P62330	175 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-208	ENST00000392449	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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