RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TPK1Q9H3S4 243 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 CRLF2Q9HC73 371 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 STUB1Q9UNE7 303 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 METTL15A6NJ78 407 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 CENPBD1B2RD01 187 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 OR4A8P0C604 315 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TGM4P49221 684 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ACTA2P62736 377 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ACTG2P63267 376 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TGFBR3Q03167 851 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 SYS1Q8N2H4 156 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 BOD1Q96IK1 185 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 PLK3Q9H4B4 646 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 CA10Q9NS85 328 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 CENPMQ9NSP4 180 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 SSR3Q9UNL2 185 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 B9A039 149 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC22A1O15245 554 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 RER1O15258 196 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 DHHO43323 396 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 PLPP2O43688 288 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 VENTXO95231 258 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 PNPP00491 289 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 KRT8P05787 483 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TACSTD2P09758 323 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 GIFP27352 417 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 GABRA5P31644 462 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 SERPINB10P48595 397 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 LSAMPQ13449 338 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM27D1Q5T7N8 215 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 VHLLQ6RSH7 139 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ABHD4Q8TB40 342 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ST7LQ8TDW4 575 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 OGG1O15527 345 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 SLC43A1O75387 559 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 PCK2Q16822 640 aa9.59□□□□□ -0.87
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RABGGTA-204ENST00000558376 KRT77Q7Z794 578 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 OR8B4Q96RC9 309 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 MROQ9BYG7 248 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 POLE4Q9NR33 117 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-204ENST00000558376 GABRPO00591 440 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-204ENST00000558376 ZFPL1O95159 310 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-204ENST00000558376 DAOP14920 347 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-204ENST00000558376 PPOXP50336 477 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-204ENST00000558376 GDI2P50395 445 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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