RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF627Q7L945 461 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SIAH3Q8IW03 269 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 TAAR6Q96RI8 345 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 PRSS50Q9UI38 385 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 WASF3Q9UPY6 502 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 A0A096LPE4 126 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 A0A1W2PPZ6 126 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 C5orf63A6NC05 138 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 CTDSPLO15194 276 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SSX4O60224 188 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 PDGFAP04085 211 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 MMP15P51511 669 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF529Q6P280 563 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SLC25A28Q96A46 364 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 LYZL4Q96KX0 146 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 PLA2G10O15496 165 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SULT1B1O43704 296 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 DHRS3O75911 302 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ARSBP15848 533 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 RFX2P48378 723 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 HACD4Q5VWC8 232 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 TRIM63Q969Q1 353 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 AKAP13Q12802 2813 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 WISP2O76076 250 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 OR3A2P47893 321 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 CAPZA1P52907 286 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 V9GYS6 101 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC5-201ENST00000312492 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 LYRM1O43325 122 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 LCATP04180 440 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 CDK2P24941 298 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 THBS4P35443 961 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 MAP2K3P46734 347 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 HGFACQ04756 655 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 LYPD6Q86Y78 171 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 ENKURQ8TC29 256 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 OR14I1A6ND48 311 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 ZNHIT1O43257 154 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 LANCL1O43813 399 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 MPGP29372 298 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 MNDAP41218 407 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 DGCR2P98153 550 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 PLA2G7Q13093 441 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 Q6ZSR3 168 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 YIPF5Q969M3 257 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 PHF21AQ96BD5 680 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 SGK3Q96BR1 496 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 C10orf35Q96D05 121 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 KCNK15Q9H427 330 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 DIABLOQ9NR28 239 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 MED12LQ86YW9 2145 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 K7EM74 188 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 CTAG2O75638 210 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 TPPPO94811 219 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 HLA-HP01893 362 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms