RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 GJC3Q8NFK1 279 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 THEM6Q8WUY1 208 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 C18orf12Q96KH6 178 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 Q96MF0 132 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 AMELYQ99218 206 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ALG8Q9BVK2 526 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.82■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PLCE1Q9P212 2302 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TMEM129A0AVI4 362 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PRR32B1ATL7 298 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OVOL3O00110 214 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 RER1O15258 196 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 HLA-HP01893 362 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ZNF32P17041 273 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PTAFRP25105 342 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CD40P25942 277 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ACTA2P62736 377 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ACTG2P63267 376 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SPOCK1Q08629 439 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CDONQ4KMG0 1287 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SVOPQ8N4V2 548 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OR10S1Q8NGN2 331 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 RNF133Q8WVZ7 376 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 B3GNT2Q9NY97 397 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ERGIC3Q9Y282 383 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa15.81■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 UBL3O95164 117 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PATE4P0C8F1 98 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TUBA4AP68366 448 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SYS1Q8N2H4 156 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ZNF485Q8NCK3 441 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OR52N1Q8NH53 320 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 RADILQ96JH8 1075 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OR8B4Q96RC9 309 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SMR3AQ99954 134 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 M0R1B8 84 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SULT1C4O75897 302 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 WNT11O96014 354 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PTHP01270 115 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CD8AP01732 235 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 INHBBP09529 407 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PCMT1P22061 227 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ARR3P36575 388 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ATP5J2P56134 94 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PSG4Q00888 419 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SNX33Q8WV41 574 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SLAMF6Q96DU3 332 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 MND1Q9BWT6 205 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OR2H1Q9GZK4 316 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.79■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TRIM64BA6NI03 449 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ZNF878C9JN71 531 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 MYL12BO14950 172 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SGCEO43556 437 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ABHD16AO95870 558 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CD79AP11912 226 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OPRL1P41146 370 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 MAP2K4P45985 399 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 CAPZA2P47755 286 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 RAB35Q15286 201 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 GSG1Q2KHT4 349 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 SLC22A25Q6T423 547 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.78■□□□□ 0.12
PTX4-201ENST00000293922 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms