RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622875.4

EBF1-211, Transcript of early B cell factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EBF1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1-211ENST00000622875 FZD4Q9ULV1 537 aa5.13□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ALG6Q9Y672 507 aa5.13□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.13□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TGP01266 2768 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 C9orf170A2RU37 121 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 OR2AG2A6NM03 316 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ANKRD28O15084 1053 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 NKX2-8O15522 239 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TGFB1I1O43294 461 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 LIASO43766 372 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 HPP00738 406 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SFTPBP07988 381 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 FDXRP22570 491 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 CYB561P49447 251 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TCL1AP56279 114 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SELENOTP62341 195 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TMEM132DQ14C87 1099 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.12□□□□□ -1.59
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EBF1-211ENST00000622875 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 MRAP2Q96G30 205 aa5.12□□□□□ -1.59
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EBF1-211ENST00000622875 MARK4Q96L34 752 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 OR7D2Q96RA2 312 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 PEBP4Q96S96 227 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ALG12Q9BV10 488 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 BOCQ9BWV1 1114 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 PPIL1Q9Y3C6 166 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 OR6C76A6NM76 312 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 E7EQ34 232 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 FAM227AF5H4B4 570 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 K7ESM1 405 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 DLX3O60479 287 aa5.12□□□□□ -1.59
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EBF1-211ENST00000622875 CDK2P24941 298 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 MPSTP25325 297 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 EPHA3P29320 983 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ARL2P36404 184 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 GEMP55040 296 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ST8SIA6P61647 398 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 NR0B2Q15466 257 aa5.12□□□□□ -1.59
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EBF1-211ENST00000622875 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 STRADAQ7RTN6 431 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 LGI3Q8N145 548 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 PYCR2Q96C36 320 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 MISP3Q96FF7 219 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SPRY4Q9C004 299 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 MAGEH1Q9H213 219 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 RAB18Q9NP72 206 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TAS2R14Q9NYV8 317 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 CNIH4Q9P003 139 aa5.12□□□□□ -1.59
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EBF1-211ENST00000622875 ASF1AQ9Y294 204 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 UNC119BA6NIH7 251 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 HSPB2A8KAH6 182 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 I6L893 689 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 KLF4O43474 513 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 NPHS1O60500 1241 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 SCELO95171 688 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 NUDT3O95989 172 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 HOXB5P09067 269 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 OR4Q2P0C623 313 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 ABOP16442 354 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 HOXA5P20719 270 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 CD247P20963 164 aa5.12□□□□□ -1.59
EBF1-211ENST00000622875 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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