RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATS1Q496A3 300 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FGD3Q5JSP0 725 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf89Q6UX73 402 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC18Q8N456 261 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 NSMAFQ92636 917 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 NABP1Q96AH0 204 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 PYURFQ96I23 114 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 RBP7Q96R05 134 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 CDRT15Q96T59 188 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SIAEQ9HAT2 523 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 CDH20Q9HBT6 801 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 CD300AQ9UGN4 299 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 TENM3Q9P273 2699 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PPL8 197 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 H7C1C5 153 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 M0R233 179 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 DYNC1I1O14576 645 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 XKRYO14609 159 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 AHCYL1O43865 530 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 DIRAS1O95057 198 aa5.5□□□□□ -1.53
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CTDSPL-208ENST00000486978 GADD45GO95257 159 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 STAMBPO95630 424 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SEMG1P04279 462 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 CST2P09228 141 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM157BP0CG42 384 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 CCL2P13500 99 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 DAOP14920 347 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF32P17041 273 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 RAD52P43351 418 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 NR4A2P43354 598 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 OMPP47874 163 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 MNAT1P51948 309 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SMIM11AP58511 58 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SELENOVP59797 346 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 LCN6P62502 163 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ERVK-25P63136 954 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SPIBQ01892 262 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SEC23BQ15437 767 aa5.5□□□□□ -1.53
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CTDSPL-208ENST00000486978 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FBLN7Q53RD9 439 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 MESTQ5EB52 335 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM27BQ5VT28 67 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM122BQ7Z309 247 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 LRP11Q86VZ4 500 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM216AQ8WUB2 273 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFAND2BQ8WV99 257 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 MCUR1Q96AQ8 359 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 Q96M85 177 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 NSMCE2Q96MF7 247 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF570Q96NI8 536 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SYT3Q9BQG1 590 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 FUZQ9BT04 418 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 TPK1Q9H3S4 243 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 AURKCQ9UQB9 309 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 V9GYQ6 96 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.5□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.49□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.49□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PPW3 197 aa5.49□□□□□ -1.53
CTDSPL-208ENST00000486978 PRSS37A4D1T9 235 aa5.49□□□□□ -1.53
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