RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437728.1

RPS3AP29-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 29, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP29, Length 769 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP29-201ENST00000437728 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 H3BNX3 289 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 LYZL6O75951 148 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 BCL10O95999 233 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 CD14P08571 375 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 PGA4P0DJD7 388 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 PGA3P0DJD8 388 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 COX6B1P14854 86 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 PPP3CBP16298 524 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 IL32P24001 234 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 MPGP29372 298 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 BIDP55957 195 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 RUNX1T1Q06455 604 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 CAMK2DQ13557 499 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 TSC22D1Q15714 1073 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 STK11Q15831 433 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 GIPC3Q8TF64 312 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 TMEM54Q969K7 222 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 NRBF2Q96F24 287 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 Q96MF0 132 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 DACH2Q96NX9 599 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 OR52D1Q9H346 318 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 UPB1Q9UBR1 384 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 AP4S1Q9Y587 144 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ZNF726A6NNF4 738 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 GNGT2O14610 69 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 E2F6O75461 281 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 RAD51DO75771 328 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 TXNDC12O95881 172 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 IGHG1P01857 330 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ACADSP16219 412 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 FASP25445 335 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 CSNK1A1P48729 337 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ERVK-25P63136 954 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 HIST3H3Q16695 136 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 CARD17Q5XLA6 110 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 FAM222BQ8WU58 562 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ZNF566Q969W8 418 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 S100PBPQ96BU1 408 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ALG12Q9BV10 488 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 GPR35Q9HC97 309 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3AP29-201ENST00000437728 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.6 ms