RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 EXD3Q8N9H8 876 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF511Q8NB15 262 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 C3orf49Q96BT1 292 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 S1PR5Q9H228 398 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF576Q9H609 170 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.86□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 A0A0G2JNG1 304 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FADS1O60427 444 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 STK17BO94768 372 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 BPNT1O95861 308 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 IFNA21P01568 189 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 S100PP25815 95 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GLO1Q04760 184 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NFATC4Q14934 902 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 KIR2DS5Q14953 304 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RAB30Q15771 203 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GUCA2BQ16661 112 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 AGBL4Q5VU57 503 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MDGA2Q7Z553 956 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF561Q8N587 486 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 OR13C3Q8NGS6 347 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ING5Q8WYH8 240 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RAB18Q9NP72 206 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GDE1Q9NZC3 331 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RNF222A6NCQ9 220 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF264O43296 627 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 OIP5O43482 229 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 AHSA1O95433 338 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NTN1O95631 604 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 IL2RAP01589 272 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PAX6P26367 422 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GRPRP30550 384 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PPICP45877 212 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PMPCAQ10713 525 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TCTN1Q2MV58 587 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SEH1LQ96EE3 360 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 C4orf51C9J302 202 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FGF16O43320 207 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LDB3O75112 727 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CBX7O95931 251 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 CA3P07451 260 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NR2C1P13056 603 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 BDKRB2P30411 391 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 EMDP50402 254 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 YPEL5P62699 121 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 RAB1AP62820 205 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 TMEM225Q6GV28 225 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MICU1Q9BPX6 476 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 LAT2Q9GZY6 243 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-202ENST00000320122 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms