RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 PLCB4Q15147 1175 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 GBP1P32455 592 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CETN3O15182 167 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CALM1P0DP23 149 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CALM2P0DP24 149 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CALM3P0DP25 149 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 FAM204AQ9H8W3 233 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CCDC125Q86Z20 511 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CSRNP2Q9H175 543 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 NOD1Q9Y239 953 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 OGFOD1Q8N543 542 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
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NFIC-211ENST00000641145 TSPY3P0CV98 308 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 TSPY8P0CW00 308 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CDR2Q01850 454 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 TRPC3Q13507 836 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 MCM6Q14566 821 aa18.3■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.3■□□□□ 0.52
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NFIC-211ENST00000641145 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 IFT74Q96LB3 600 aa18.29■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.29■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.29■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.29■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ZEB2O60315 1214 aa18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 PTGS1P23219 599 aa18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 PCK1P35558 622 aa18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CALCOCO2Q13137 446 aa18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 HAUS8Q9BT25 410 aa18.28■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CTAGE15A4D2H0 777 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CTAGE8P0CG41 777 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CCDC102BQ68D86 513 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.523e-6■■□□□ 13.5
NFIC-211ENST00000641145 PDE3AQ14432 1141 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 TAOK1Q7L7X3 1001 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 STX8Q9UNK0 236 aa18.27■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 STX10O60499 249 aa18.27■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 UBASH3AP57075 661 aa18.27■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.27■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 PANK2Q9BZ23 570 aa18.27■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 VCX3AQ9NNX9 186 aa18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 EBAG9O00559 213 aa18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.26■□□□□ 0.51
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NFIC-211ENST00000641145 KRT5P13647 590 aa18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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NFIC-211ENST00000641145 PPP2R5DQ14738 602 aa18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 SEL1L2Q5TEA6 688 aa18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.25■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 MYD88Q99836 296 aa18.25■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.25■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 KIFAP3Q92845 792 aa18.25■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.25■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.25■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.25■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 MICU3Q86XE3 530 aa18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 RFC4P35249 363 aa18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.24■□□□□ 0.51
NFIC-211ENST00000641145 NEK11Q8NG66 645 aa18.23■□□□□ 0.51
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