RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531296.1

FRMD8-208, Transcript of FERM domain containing 8, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FRMD8, Length 366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FRMD8-208	ENST00000531296	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		27.76	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.76	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	KSR2	Q6VAB6	950 aa		27.76	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		27.76	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	DPF2	Q92785	391 aa		27.76	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.76	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	G2E3	Q7L622	706 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	PSME4	Q14997	1843 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	SPEF2	Q9C093	1822 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	EYA3	Q99504	573 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296		H7C1D1	291 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	UFL1	O94874	794 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	IL16	Q14005	1332 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	LBX1	P52954	281 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	CTSW	P56202	376 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	DLK2	Q6UY11	383 aa		27.72	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	GGA1	Q9UJY5	639 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FRMD8-208	ENST00000531296	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	STK31	Q9BXU1	1019 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	ECE1	P42892	770 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	GRM1	Q13255	1194 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	ZNF609	O15014	1411 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	AOC2	O75106	756 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	GREM2	Q9H772	168 aa		27.68	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	XDH	P47989	1333 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	SLC4A2	P04920	1241 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.66	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	CACNA1F	O60840	1977 aa		27.66	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296		H7C1W4	665 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	FLII	Q13045	1269 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		27.64	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
FRMD8-208	ENST00000531296	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	CASP7	P55210	303 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	GML	Q99445	158 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	MAP2K2	P36507	400 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	GCKR	Q14397	625 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	VAMP4	O75379	141 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296		G3V3G9	751 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	ANP32C	O43423	234 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	TSKS	Q9UJT2	592 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FRMD8-208	ENST00000531296	HUNK	P57058	714 aa		27.57	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.57	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.56	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.56	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296	LINS1	Q8NG48	757 aa		27.55	■■■□□ 2
FRMD8-208	ENST00000531296		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.55	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms