RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524509.1

PACSIN3-202, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-202ENST00000524509 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 CSF1RP07333 972 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-202ENST00000524509 SLC34A2O95436 690 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 CNTROBQ8N137 903 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 FZD9O00144 591 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 CCDC57Q2TAC2 916 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 DDX19BQ9UMR2 479 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 ABHD8Q96I13 439 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 GNAI2P04899 355 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 FOXO4P98177 505 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 GPC2Q8N158 579 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 SUCLG2Q96I99 432 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 OLFM4Q6UX06 510 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 SP8Q8IXZ3 490 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 ITGA6P23229 1130 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 PANK1Q8TE04 598 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 MEIS3Q99687 375 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 GREM2Q9H772 168 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-202ENST00000524509 PLIN1O60240 522 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 LAMB2P55268 1798 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 RLBP1P12271 317 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 PSMD1Q99460 953 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 FAM161AQ3B820 660 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 SNED1Q8TER0 1413 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 JDP2Q8WYK2 163 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 TNNQ9UQP3 1299 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 VPS33BQ9H267 617 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 KAZALD1Q96I82 304 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 FBXO3Q9UK99 471 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 COG6Q9Y2V7 657 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 MTX1Q13505 466 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 AAMPQ13685 434 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 MPNDQ8N594 471 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-202ENST00000524509 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 ECE1P42892 770 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 LTBP1Q14766 1721 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 CAPNS2Q96L46 248 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 COL4A5P29400 1685 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 XDHP47989 1333 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 RGS19P49795 217 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 SCNN1DP51172 638 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 EYA3Q99504 573 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-202ENST00000524509 SRGAP3O43295 1099 aa21.85■■□□□ 1.09
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