RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	GPSM2	P81274	684 aa		14.29	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	GREM2	Q9H772	168 aa		14.29	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		14.29	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246		H7C1D1	291 aa		14.28	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		14.28	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		14.28	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	SNED1	Q8TER0	1413 aa		14.27	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF16B	Q96L93	1317 aa		14.27	□□□□□ -0.12
TTLL3-231	ENST00000496246	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	14.27	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		14.27	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		14.27	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	ECE2	O60344	883 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD17	O75943	681 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL9	Q07325	125 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM161A	Q3B820	660 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	POLL	Q9UGP5	575 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF1	P21675	1872 aa		14.26	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		14.25	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	CSF1R	P07333	972 aa		14.25	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEC	B2RU33	542 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	DOK7	Q18PE1	504 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	PODN	Q7Z5L7	613 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		14.24	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP7	P55210	303 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	DPF2	Q92785	391 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXW7	Q969H0	707 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	MED23	Q9ULK4	1368 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	EPS15	P42566	896 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	SCNN1D	P51172	638 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTROB	Q8N137	903 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	COA1	Q9GZY4	146 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L3	A6NCW0	530 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L4	A6NCW7	530 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMD14	O00487	310 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXO4	P98177	505 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRND	Q07001	517 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	OGFOD1	Q8N543	542 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	YDJC	A8MPS7	323 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	PLIN1	O60240	522 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP14	P50281	582 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC51A	Q86UW1	340 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	MICALL2	Q8IY33	904 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	CREBZF	Q9NS37	354 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	UTY	O14607	1347 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	SPEF2	Q9C093	1822 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS37D	Q86XT2	251 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	SUCLG2	Q96I99	432 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	COL4A5	P29400	1685 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	GNAI3	P08754	354 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEI	P0CG38	1075 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEJ	P0CG39	1038 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	KLRG1	Q96E93	195 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L8	P0C7I0	530 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL24	Q5JXM2	366 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		14.16	□□□□□ -0.14

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