RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 PDE3AQ14432 1141 aa41.18■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 TAF7LQ5H9L4 462 aa41.18■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 C20orf194Q5TEA3 1177 aa41.18■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 PODXL2Q9NZ53 605 aa41.18■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 A0A1B0GUL6 1792 aa41.18■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 GNAI2P04899 355 aa41.18■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 MVPQ14764 893 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 SUPT20HQ8NEM7 779 aa41.17■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 COG6Q9Y2V7 657 aa41.17■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa41.16■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 POLLQ9UGP5 575 aa41.15■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 XDHP47989 1333 aa41.15■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 COL4A5P29400 1685 aa41.14■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 RRP1P56182 461 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa41.13■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 TBC1D16Q8TBP0 767 aa41.13■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 VPS33BQ9H267 617 aa41.11■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 CHRNDQ07001 517 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 MTX1Q13505 466 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 KLHDC4Q8TBB5 520 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 CNNM1Q9NRU3 951 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 GGA1Q9UJY5 639 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 DDX19BQ9UMR2 479 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 C6orf229H3BNL8 230 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 PPIP5K2O43314 1243 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 UFL1O94874 794 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 AOC3Q16853 763 aa41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 LARGE2Q8N3Y3 721 aa41.09■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 KIAA2012Q0VF49 1180 aa41.08■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD2Q9GZV1 360 aa41.08■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 C1orf115Q9H7X2 142 aa41.08■■■■■ 4.17
CHKB-210ENST00000484266 ATP2B4P23634 1241 aa41.07■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 WASHC4Q2M389 1173 aa41.05■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa41.05■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 SRGAP3O43295 1099 aa41.04■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 LRRC24Q50LG9 513 aa41.04■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 JDP2Q8WYK2 163 aa41.04■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 EYA3Q99504 573 aa41.04■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 LEMD3Q9Y2U8 911 aa41.02■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 TAF5LO75529 589 aa41.01■■■■■ 4.16
CHKB-210ENST00000484266 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa41.01■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 RIMBP2O15034 1052 aa41.01■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 NIM1KQ8IY84 436 aa41.01■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa41.01■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 FZD9O00144 591 aa41■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 COPRSQ9NQ92 184 aa41■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 ZNF804BA4D1E1 1349 aa40.99■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 MROH5Q6ZUA9 1318 aa40.99■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 EYA2O00167 538 aa40.99■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
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CHKB-210ENST00000484266 MED23Q9ULK4 1368 aa40.97■■■■■ 4.15
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CHKB-210ENST00000484266 SIL1Q9H173 461 aa40.96■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 FBXO3Q9UK99 471 aa40.96■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 ATG9AQ7Z3C6 839 aa40.95■■■■■ 4.15
CHKB-210ENST00000484266 ZNF541Q9H0D2 1346 aa40.95■■■■■ 4.15
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CHKB-210ENST00000484266 KCNJ4P48050 445 aa40.94■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 METTL24Q5JXM2 366 aa40.94■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 CEP85Q6P2H3 762 aa40.94■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 ZNRF3Q9ULT6 936 aa40.94■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 GLTPD2A6NH11 291 aa40.93■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 POLA2Q14181 598 aa40.93■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 VGLL2Q8N8G2 317 aa40.93■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
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CHKB-210ENST00000484266 KLRK1P26718 216 aa40.92■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 DOK7Q18PE1 504 aa40.92■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 DPY19L2Q6NUT2 758 aa40.91■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 TXNRD3Q86VQ6 643 aa40.91■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 IRS2Q9Y4H2 1338 aa40.9■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 YDJCA8MPS7 323 aa40.9■■■■■ 4.14
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CHKB-210ENST00000484266 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 PDE8BO95263 885 aa40.89■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 KDM2BQ8NHM5 1336 aa40.89■■■■■ 4.14
CHKB-210ENST00000484266 ECE2O60344 883 aa40.88■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 UBE4AQ14139 1066 aa40.88■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 SCN9AQ15858 1988 aa40.88■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 DDNO94850 711 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 IL15P40933 162 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 WDR90Q96KV7 1748 aa40.86■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 G3V3G9 751 aa40.84■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 CXCL9Q07325 125 aa40.84■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 DCAF8Q5TAQ9 597 aa40.84■■■■■ 4.13
CHKB-210ENST00000484266 PSME4Q14997 1843 aa40.84■■■■■ 4.13
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