RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
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RAB11B-201ENST00000328024 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.21■■□□□ 1.63
RAB11B-201ENST00000328024 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RAB11B-201ENST00000328024 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.21■■□□□ 1.63
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RAB11B-201ENST00000328024 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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RAB11B-201ENST00000328024 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.19■■□□□ 1.62
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RAB11B-201ENST00000328024 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.19■■□□□ 1.62
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RAB11B-201ENST00000328024 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.18■■□□□ 1.62
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RAB11B-201ENST00000328024 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.18■■□□□ 1.62
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RAB11B-201ENST00000328024 RNF181Q9P0P0 153 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC24Q50LG9 513 aa25.18■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.17■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 COL4A5P29400 1685 aa25.17■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 SRGAP3O43295 1099 aa25.16■■□□□ 1.62
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RAB11B-201ENST00000328024 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.16■■□□□ 1.62
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RAB11B-201ENST00000328024 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 XDHP47989 1333 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 SNAP23O00161 211 aa25.14■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 TAF5LO75529 589 aa25.14■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 ATP8B2P98198 1209 aa25.14■■□□□ 1.62
RAB11B-201ENST00000328024 AOC3Q16853 763 aa25.13■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 C6orf229H3BNL8 230 aa25.13■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 UFL1O94874 794 aa25.13■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 CEP85Q6P2H3 762 aa25.13■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 CRBNQ96SW2 442 aa25.13■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 GGA1Q9UJY5 639 aa25.13■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1B0GUL6 1792 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 POLA2Q14181 598 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 SIL1Q9H173 461 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 COPRSQ9NQ92 184 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 EYA2O00167 538 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 RIMBP2O15034 1052 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 PPIP5K2O43314 1243 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 ATP2B4P23634 1241 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 SSH3Q8TE77 659 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 WASHC4Q2M389 1173 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 KLRK1P26718 216 aa25.09■■□□□ 1.61
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RAB11B-201ENST00000328024 YY1P25490 414 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 VPS33BQ9H267 617 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.08■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.08■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 CIAO1O76071 339 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 METTL24Q5JXM2 366 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 EYA3Q99504 573 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 FBXO3Q9UK99 471 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 FZD9O00144 591 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 DOK7Q18PE1 504 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 PDE8BO95263 885 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 JDP2Q8WYK2 163 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 YDJCA8MPS7 323 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 MED23Q9ULK4 1368 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 NIM1KQ8IY84 436 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 KCNJ4P48050 445 aa25.02■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.02■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.02■■□□□ 1.6
RAB11B-201ENST00000328024 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 UBE4AQ14139 1066 aa25.01■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.01■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.01■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 SASH1O94885 1247 aa25■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 FGFR2P21802 821 aa25■■□□□ 1.59
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