RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRM8O00222 908 aa26.17■■□□□ 1.78
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.17■■□□□ 1.78
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEMFO60524 1076 aa26.15■■□□□ 1.78
GRAMD1A-201ENST00000317991 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.15■■□□□ 1.78
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP28Q96RU2 1077 aa26.15■■□□□ 1.78
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB22O15209 634 aa26.14■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.14■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.14■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP21A2P08686 494 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 GUCY1B3Q02153 619 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERO1AQ96HE7 468 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGD1P98174 961 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF446Q9NWS9 450 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 JCADQ9P266 1359 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 NBPF11Q86T75 865 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 KINO60870 393 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLU7O95391 586 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTAGE5O15320 804 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTDNEP1O95476 244 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT32Q14532 448 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 LINS1Q8NG48 757 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANO10Q9NW15 660 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM53CQ9NYF3 392 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 FSIP1Q8NA03 581 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ME1P48163 572 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERICH4A6NGS2 130 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 APOBRQ0VD83 1088 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.08■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGKV5-2P06315 115 aa26.08■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.08■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF3Q5VWG9 929 aa26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF609O15014 1411 aa26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 DIP2AQ14689 1571 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYT10Q6XYQ8 523 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1B0GVL5 298 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 PFKFB2O60825 505 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A0G2JLW4 131 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 IP6K1Q92551 441 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 SDF4Q9BRK5 362 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 UTYO14607 1347 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMC2O95347 1197 aa26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHST3Q7LGC8 479 aa26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMC6Q7Z403 805 aa26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 TFCP2Q12800 502 aa26.03■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFNKQ9P0W0 207 aa26.03■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP5JP18859 108 aa26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSDMDP57764 484 aa26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 BIN1O00499 593 aa26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCND1Q9NSA2 647 aa26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.01■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 L2HGDHQ9H9P8 463 aa26.01■■□□□ 1.76
GRAMD1A-201ENST00000317991 NDUFA8P51970 172 aa26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1A-201ENST00000317991 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1A-201ENST00000317991 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1A-201ENST00000317991 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM51Q9NW97 253 aa26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.6 ms