RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 A0A0G2JLW4 131 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 COPRSQ9NQ92 184 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 KRT32Q14532 448 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 USP16Q9Y5T5 823 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 ARID5BQ14865 1188 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 FGD1P98174 961 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
PDE4A-201ENST00000293683 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 CTDNEP1O95476 244 aa20.39■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.39■□□□□ 0.85
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PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD7Q92527 254 aa20.39■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.39■□□□□ 0.85
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PDE4A-201ENST00000293683 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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PDE4A-201ENST00000293683 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.38■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 IQCB1Q15051 598 aa20.38■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 GUCY1B3Q02153 619 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 RGPD5Q99666 1765 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 TNNT1P13805 278 aa20.37■□□□□ 0.85
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PDE4A-201ENST00000293683 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.37■□□□□ 0.85
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PDE4A-201ENST00000293683 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PDE4A-201ENST00000293683 CHST3Q7LGC8 479 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 FBXW7Q969H0 707 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 USP28Q96RU2 1077 aa20.36■□□□□ 0.85
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PDE4A-201ENST00000293683 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 SLIT3O75094 1523 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 A0A087WZG4 1122 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 USP27XA6NNY8 438 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 GOLIM4O00461 696 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 PFKFB2O60825 505 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 LAMA4Q16363 1823 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4A-201ENST00000293683 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 PHKG2P15735 406 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 DMTNQ08495 405 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF592Q92610 1267 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.32■□□□□ 0.84
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PDE4A-201ENST00000293683 TIMM10P62072 90 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 STX1AQ16623 288 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 CASP7P55210 303 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 CDC25BP30305 580 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 ME1P48163 572 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4A-201ENST00000293683 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.3■□□□□ 0.84
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