RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM81AQ8TBF8 368 aa10.14□□□□□ -0.79
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF175Q9Y473 711 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 DOCK7Q96N67 2140 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC22A20A6NK97 555 aa10.11□□□□□ -0.79
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