RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 LIN54Q6MZP7 749 aa13.52□□□□□ -0.25
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TOP3B-206ENST00000436282 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
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TOP3B-206ENST00000436282 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.51□□□□□ -0.25
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TOP3B-206ENST00000436282 TVP23AA6NH52 213 aa13.5□□□□□ -0.25
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TOP3B-206ENST00000436282 BEX5Q5H9J7 111 aa13.5□□□□□ -0.25
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TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
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TOP3B-206ENST00000436282 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 EDEM2Q9BV94 578 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 SPTBP11277 2137 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 DCTN6O00399 190 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO45P0C2W1 286 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 ALOX5APP20292 161 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TOP3B-206ENST00000436282 KIR3DL2P43630 455 aa13.5□□□□□ -0.25
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