RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589050.1

RPRD1A-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 1 (best)

Gene RPRD1A, Length 1,022 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-208	ENST00000589050	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	FOXB1	Q99853	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPRD1A-208	ENST00000589050	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050		A0A096LPE4	126 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050		A0A1W2PPL8	197 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CTLA4	P16410	223 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CRABP1	P29762	137 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SORD	Q00796	357 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ETFDH	Q16134	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GABRA6	Q16445	453 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OTULIN	Q96BN8	352 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	S100PBP	Q96BU1	408 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	DDO	Q99489	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050		M0R129	80 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	DCTN6	O00399	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	DLGAP1	O14490	977 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	B4GALT1	P15291	398 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HOXC12	P31275	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CDA	P32320	146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CENPA	P49450	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HTRA1	Q92743	480 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MUS81	Q96NY9	551 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MED20	Q9H944	212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PRKY	O43930	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PPP3CB	P16298	524 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GGT2	P36268	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PEX19	P40855	299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SLC25A1	P53007	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CDC42	P60953	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SGCA	Q16586	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR2T4	Q8NH00	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FLNC	Q14315	2725 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050		A0A1W2PR80	420 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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