RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0U1RQK1	487 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	AGAP5	A6NIR3	686 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAD51C	O43502	376 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	NPIPB7	O75200	414 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	WNT2	P09544	360 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLL1	P15814	213 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SOAT1	P35610	550 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PKNOX1	P55347	436 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00310	P59036	64 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	EGR4	Q05215	589 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBBP4	Q09028	425 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPS8	Q12929	822 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAB1	Q13506	487 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTGR1	Q14914	329 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	GALNTL6	Q49A17	601 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM201A	Q5SY85	155 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	THEM4	Q5T1C6	240 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF130	Q86XS8	419 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CMIP	Q8IY22	773 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	MGARP	Q8TDB4	240 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNX33	Q8WV41	574 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	DYRK2	Q92630	601 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PMM1	Q92871	262 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCT7	Q99832	543 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SH3GL3	Q99963	347 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIF1	Q9H611	641 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf95	Q9H693	158 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf109	Q9NX04	203 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDR45	Q9Y484	360 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	HERC2	O95714	4834 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	TGDS	O95455	350 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB36	O95755	333 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3-13	P01766	116 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00032	P0C843	101 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRPH2	P23942	346 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	IER3	P46695	156 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKAA2	P54646	552 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNB2	P62879	340 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	HOXC5	Q00444	222 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CAMK2D	Q13557	499 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYPL1	Q16563	259 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATG16L1	Q676U5	607 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CADM2	Q8N3J6	435 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM86B	Q8N661	226 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	FITM2	Q8N6M3	262 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKFN1	Q8N957	763 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF519	Q8TB69	540 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	ROPN1L	Q96C74	230 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC126	Q96EE4	140 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	TBX15	Q96SF7	602 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERP44	Q9BS26	406 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOX4	Q9NPH5	578 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	RASD1	Q9Y272	281 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM233	B4DJY2	109 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	C22orf46	C9J442	243 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	MS4A18	H0YCH9	400 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	CFLAR	O15519	480 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERPINA5	P05154	406 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF43	P17038	809 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27

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