RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, humanhuman

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13-209ENST00000511467 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 RAB1AP62820 205 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 SH3BP2P78314 561 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 CDK5R2Q13319 367 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 OR2F1Q13607 317 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF620Q6ZNG0 422 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 OR2M7Q8NG81 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 OR4F15Q8NGB8 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 C11orf40Q8WZ69 217 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 TAAR9Q96RI9 348 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 MAP3K3Q99759 626 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 PIEZO1Q92508 2521 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 TVP23AA6NH52 213 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 CDKN2CP42773 168 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 XCR1P46094 333 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 CD276Q5ZPR3 534 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 NAXEQ8NCW5 288 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF480Q8WV37 535 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 OXGR1Q96P68 337 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 PIGMQ9H3S5 423 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 NECAP2Q9NVZ3 263 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 TRABD2BA6NFA1 517 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 FAM25EA8MYX2 175 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 J3QLW9 94 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 SCRG1O75711 98 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 CBX7O95931 251 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF19P17023 458 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 TBXA2RP21731 343 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 CEACAM3P40198 252 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 P2RY2P41231 377 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 DNASE1L3Q13609 305 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 TIGITQ495A1 244 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 MIDNQ504T8 468 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 OR51S1Q8NGJ8 323 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 S1PR3Q99500 378 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 C20orf85Q9H1P6 137 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF576Q9H609 170 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 CLEC4EQ9ULY5 219 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 TRIM77I1YAP6 450 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ARHGAP33O14559 1287 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 PPP1R2P9O14990 202 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 SGCEO43556 437 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 B4GALT2O60909 372 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 NDUFB7P17568 137 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 BPIFB3P59826 476 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPN13-209ENST00000511467 SLC22A25Q6T423 547 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF615Q8N8J6 731 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 SGK3Q96BR1 496 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF75AQ96N20 296 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 TXNIPQ9H3M7 391 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF69Q9UC07 566 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 SDHAP31040 664 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 GDF10P55107 478 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPN13-209ENST00000511467 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.55□□□□□ -1.68
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