RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 MUC13Q9H3R2 512 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 IL1RAPQ9NPH3 570 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 INIPQ9NRY2 104 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 AMDHD2Q9Y303 409 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 AKAP9Q99996 3911 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 A0A096LPE4 126 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PPZ6 126 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CDC42EP2O14613 210 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CLOCKO15516 846 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 BCL10O95999 233 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 RAF1P04049 648 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 FABP3P05413 133 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CD3EP07766 207 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SAGP10523 405 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CD53P19397 219 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ZNF83P51522 516 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 PRPS1P60891 318 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 RUNX1T1Q06455 604 aa13.75□□□□□ -0.21
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ACTB-206ENST00000443528 MTX3Q5HYI7 312 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 FGD3Q5JSP0 725 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.75□□□□□ -0.21
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ACTB-206ENST00000443528 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa13.75□□□□□ -0.21
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ACTB-206ENST00000443528 OR52J3Q8NH60 311 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 TMEM54Q969K7 222 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 THTPAQ9BU02 230 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 AKAP6Q13023 2319 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PRG6 482 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ACOT8O14734 319 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 PGA4P0DJD7 388 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 PGA3P0DJD8 388 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 DNASE1P24855 282 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 HOXC12P31275 282 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 GPR4P46093 362 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 OMPP47874 163 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CSNK1A1P48729 337 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 TESK1Q15569 626 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ALG10Q5BKT4 473 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ADAM5Q6NVV9 412 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 PGM2L1Q6PCE3 622 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 RRM2BQ7LG56 351 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 OAFQ86UD1 273 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CDK20Q8IZL9 346 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 KBTBD8Q8NFY9 601 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 OR13C2Q8NGS9 318 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 OR51A7Q8NH64 312 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ASB10Q8WXI3 467 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 NEUROG1Q92886 237 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ZNF566Q969W8 418 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 MCUR1Q96AQ8 359 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ASB9Q96DX5 294 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SEPHS2Q99611 448 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 OBP2BQ9NPH6 170 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 GLTPQ9NZD2 209 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ALPK2Q86TB3 2170 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CREBBPQ92793 2442 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SHISA9B4DS77 424 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 M0R1B8 84 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 HS3ST1O14792 307 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 GYG2O15488 501 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SEC14L2O76054 403 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 GADD45GO95257 159 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 WNT11O96014 354 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 CD40P25942 277 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 MAGEA2P43356 314 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 LIMS1P48059 325 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SLC9A3P48764 834 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 TUBA1BP68363 451 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 TUBA4AP68366 448 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SPIBQ01892 262 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 SPOCK1Q08629 439 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-206ENST00000443528 BNIP1Q12981 228 aa13.73□□□□□ -0.21
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