RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBBP9O75884 186 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GKN3PP0CG01 181 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGAM1P18669 254 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CELP19835 753 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BPIFB3P59826 476 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBX1P83916 185 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPYSL2Q16555 572 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF683Q8IZ20 524 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGAM4Q8N0Y7 254 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZADH2Q8N4Q0 377 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IPMKQ8NFU5 416 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ECSITQ9BQ95 431 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPPP3Q9BW30 176 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GBA3Q9H227 469 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF14Q9UBS8 474 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR12D3Q9UGF7 316 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFASCO94856 1347 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP10AO60312 1499 aa2.31□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBX19O60806 448 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IDH1O75874 414 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIRAS1O95057 198 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSF3P09919 207 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNA11P29992 359 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLD1Q13393 1074 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5I1Q13606 314 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK11Q15831 433 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMRTC1Q5HYR2 192 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NANOGP8Q6NSW7 305 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACOT4Q8N9L9 421 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2T34Q8NGX1 318 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAIP1Q8WWC4 291 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2A5Q96R48 311 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIRT7Q9NRC8 400 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMP17Q9ULZ9 603 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMCO1Q9UM00 188 aa2.3□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLA2R1Q13018 1463 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GVX0 72 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL21EPA6NDL7 271 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BNH8 94 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XKRYO14609 159 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAMP3O60896 148 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMPD2O60906 423 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM10L1P0DMW3 83 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC130P13994 396 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OPRD1P41143 372 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDK4Q16654 411 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTLL9Q3SXZ7 439 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NADK2Q4G0N4 442 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM225Q6GV28 225 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM92BQ6ZTR7 304 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNDC5Q8NAU1 212 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTNBP1Q96EV8 351 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM10Q96HG1 83 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SENP8Q96LD8 212 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YY1AP1Q9H869 796 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PALMDQ9NP74 551 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35D1Q9NTN3 355 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMOXQ9NWM0 555 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGA2Q9UJY4 613 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR179Q6PRD1 2367 aa2.29□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC182A6NF36 153 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5B21A6NL26 309 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H0YHG0 523 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQCF3P0C7M6 154 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GYG1P46976 350 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERVK-25P63136 954 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFT2D3Q587I9 215 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XKR4Q5GH76 650 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAX1Q5SQQ9 334 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H2AFVQ71UI9 128 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5W2Q8NH69 310 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMARCD2Q92925 531 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLCC1Q96S66 551 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms