RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 GXYLT2A0PJZ3 443 aa13.67□□□□□ -0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 CTNSO60931 367 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DIO1P49895 249 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 RPS21P63220 83 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PON3Q15166 354 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 KCT2Q8NC54 265 aa13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 FGF14Q92915 247 aa13.67□□□□□ -0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GW55 424 aa13.66□□□□□ -0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 DUX4L2P0CJ85 424 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DUX4L3P0CJ86 424 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DUX4L4P0CJ87 422 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DUX4L5P0CJ88 424 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DUX4L6P0CJ89 424 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DUX4L7P0CJ90 424 aa13.66□□□□□ -0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 MAGEB1P43366 347 aa13.66□□□□□ -0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 GLB1L2Q8IW92 636 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 OR4N5Q8IXE1 308 aa13.66□□□□□ -0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 NPAS1Q99742 590 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A32Q9H2D1 315 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 FGF22Q9HCT0 170 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ADAP2Q9NPF8 381 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DUX4Q9UBX2 424 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01565O15544 149 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 GLSO94925 669 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 KDM4BO94953 1096 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 AK4P27144 223 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 MPGP29372 298 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 CMPK1P30085 196 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 RPE65Q16518 533 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF425Q6IV72 752 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35F3Q8IY50 421 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF426Q9BUY5 554 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP22Q9NRW4 184 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 OBP2AQ9NY56 170 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 FLRT3Q9NZU0 649 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF175Q9Y473 711 aa13.66□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GWA3 101 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ZFPL1O95159 310 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SPDEFO95238 335 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 NGFRP08138 427 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 RBM34P42696 430 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 MELKQ14680 651 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF12L2Q5VW00 463 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 STAC2Q6ZMT1 411 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PXT1Q8NFP0 134 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 OR4C16Q8NGL9 310 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 APOOQ9BUR5 198 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 MFFQ9GZY8 342 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SLITRK2Q9H156 845 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 TRPV4Q9HBA0 871 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 MPTX1A8MV57 137 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 IDSB3KWA1 339 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 GPR89AB7ZAQ6 455 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ABCD4O14678 606 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PRAMEF2O60811 474 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 RBBP9O75884 186 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFB2O95178 105 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 IGF2P01344 180 aa13.65□□□□□ -0.22
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TOP3B-206ENST00000436282 RLN1P04808 185 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 GPR89BP0CG08 455 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PCGF3Q3KNV8 242 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 FHL5Q5TD97 284 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SHEQ5VZ18 495 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 TSSK4Q6SA08 328 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ZNRF4Q8WWF5 429 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 ASB13Q8WXK3 278 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 HSPA12BQ96MM6 686 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA4CQ9C0C4 833 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 TCF7L1Q9HCS4 588 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 POM121BA6NF01 834 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 H7C417 338 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 EML2O95834 649 aa13.65□□□□□ -0.22
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