RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ercc1P07903 298 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gabrg2P22723 474 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 B230104I21RikQ3USW4 141 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf354aQ61751 572 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ptpn21Q62136 1176 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rtp2Q80ZI2 223 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hbq1aQ8BYM1 145 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 GmprQ9DCZ1 345 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 PolmQ9JIW4 496 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr396-ps1A0A0U1RNF5 211 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 SrsxB2RZI1 361 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp81B8JJZ7 531 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kbtbd7G5E8C2 690 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pcsk4P29121 655 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Agtr1bP29755 359 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mmp12P34960 473 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 CpoxP36552 443 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 2410002F23RikQ3TE80 284 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Steap3Q8CI59 488 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Il23rQ8K4B4 644 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 StradbQ8K4T3 418 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rab3bQ9CZT8 219 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm45692D3Z0A0 150 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atpif1O35143 106 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Psmb5O55234 264 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mab21l1O70299 359 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mbl2P41317 244 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dynlrb1P62627 96 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 PkibQ04758 92 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1136Q0VBI4 310 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc30a8Q8BGG0 367 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Arfrp1Q8BXL7 201 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pias2Q8C5D8 621 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem125Q8CHQ6 216 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mrgpra6Q91ZC6 301 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ddah2Q99LD8 285 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp993A2A8V4 313 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cela3aA2A9U8 283 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpr52P0C5J4 361 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Doc2bP70169 412 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rpa2Q62193 270 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Katnb1Q8BG40 658 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 2810021J22RikQ8BIB6 539 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 IlvblQ8BU33 632 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpr152Q8BXS7 511 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Chpt1Q8C025 398 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mboat2Q8R3I2 519 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Naalad2Q9CZR2 740 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spag4Q9JJF2 443 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mgat4aQ812G0 535 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Noxo1Q8VCM2 349 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Txndc17Q9CQM5 123 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ca13Q9D6N1 262 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trappc4Q9ES56 219 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Phlda2O08969 144 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hmx2P43687 273 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Npbwr1P49681 329 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 IfnkQ7TSL0 199 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sult2a8Q8BGL3 282 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc25a40Q8BGP6 337 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam124bQ8BLQ0 456 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pggt1bQ8BUY9 377 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr510Q8VEW6 314 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pskh1Q91YA2 424 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Yif1bQ9CX30 311 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyhr1Q9QXA1 311 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Srpk3Q9Z0G2 565 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cldn34aG3UW52 211 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm6614M0QWR8 670 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 OmgQ63912 440 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 PigwQ8C398 503 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem200aQ8C817 491 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sh2d5Q8JZW5 429 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1090Q8VGA6 313 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 ApmapQ9D7N9 415 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sema6cQ9WTM3 931 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rp1P56716 2095 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1303A2AVW1 312 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm20518E9Q548 580 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q5SPV6 233 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Surf4Q64310 269 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 DmknQ6P253 517 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atg4bQ8BGE6 393 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1389Q8VGX0 311 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cts7Q91ZF2 331 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Klhl1Q9JI74 751 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 DptQ9QZZ6 201 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Klk1b8P07628 261 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fpr-rs7Q71MR7 338 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Isoc1Q91V64 297 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ints12Q9D168 461 aa5.44□□□□□ -1.54
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc30a7Q9JKN1 378 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.5 ms