RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	HIST1H2AB	P04908	130 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	OSM	P13725	252 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CPN1	P15169	458 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RAD23A	P54725	363 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	NUP107	P57740	925 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SLC35A1	P78382	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SGCB	Q16585	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RFX4	Q33E94	735 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ZBED5	Q49AG3	693 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	GHDC	Q8N2G8	530 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	OR5J2	Q8NH18	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	OR51A7	Q8NH64	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RDH12	Q96NR8	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	OR52D1	Q9H346	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	TOR3A	Q9H497	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996		H0YJX3	145 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996		H3BN98	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ZNHIT1	O43257	154 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	DNPH1	O43598	174 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PTP4A3	O75365	173 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	TSPAN19	P0C672	248 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	KLK2	P20151	261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	UQCRC1	P31930	480 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	AQP2	P41181	271 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	P2RY4	P51582	365 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CARD18	P57730	90 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RAC3	P60763	192 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ESRRG	P62508	458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	NPRL3	Q12980	569 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SLC36A3	Q495N2	470 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM99	Q8N816	258 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	OSTF1	Q92882	214 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996		A0A1W2PNV4	684 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PLPP3	O14495	311 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	NDUFB2	O95178	105 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	RCBTB2	O95199	551 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	ADORA3	P0DMS8	318 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	POU1F1	P28069	291 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	EPHA2	P29317	976 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	CRISP1	P54107	249 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	PRPS1	P60891	318 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RNF13-208	ENST00000467996	H3F3A	P84243	136 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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