RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 NUAK2Q9H093 628 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A075B6Q4 140 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 C9J4A7 227 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2J2O76002 312 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TXNDC12O95881 172 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TFP02787 698 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PON3Q15166 354 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LEG1Q6P5S2 330 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 POMGNT2Q8NAT1 580 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 KCTD7Q96MP8 289 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TMED9Q9BVK6 235 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 A8MVM7 634 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 IL1AP01583 271 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MT-ND5P03915 603 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SDHAP31040 664 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 S100A5P33763 92 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RORCP51449 518 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR50Q13585 617 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 BICRALQ6AI39 1079 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SSX6Q7RTT6 188 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SERPINI2O75830 405 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MT-ATP6P00846 226 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HTR3AP46098 478 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HCCSP53701 268 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MXD1Q05195 221 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 IL10RAQ13651 578 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 BTBD16Q32M84 506 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RFLNBQ8N5W9 214 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SYT14Q8NB59 555 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC22A8Q8TCC7 542 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM234Q8WY98 164 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 C4orf36Q96KX1 117 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPAN32Q96QS1 320 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CMKLR1Q99788 373 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 NDEL1Q9GZM8 345 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MED11Q9P086 117 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 E9PI62 339 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TAF4O00268 1085 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF13O43567 381 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 DKK1O94907 266 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HLA-DPB1P04440 258 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXO45P0C2W1 286 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF12P17014 697 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PRKCAP17252 672 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC25A1P53007 311 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP5CP53041 499 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR12D2P58182 307 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 IFITM3Q01628 133 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 EMC4Q5J8M3 183 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM69AQ5T7M9 428 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 Q6ZNX1 250 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 EXD3Q8N9H8 876 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 STK35Q8TDR2 534 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ST8SIA1Q92185 356 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RASL10BQ96S79 203 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 NPAS1Q99742 590 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 COQ7Q99807 217 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MED18Q9BUE0 208 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.7 ms