RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429190.2

NANOGP6-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP6, Length 847 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP6-201ENST00000429190 PAX6P26367 422 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PTPN6P29350 595 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SERPINA4P29622 427 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 CCR1P32246 355 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 BTCP35070 178 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SPAM1P38567 509 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 NNMTP40261 264 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 XCR1P46094 333 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 RGS4P49798 205 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 DAOAP59103 153 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ERVK-25P63136 954 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 HSF1Q00613 529 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 B4GALNT1Q00973 533 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 BDH1Q02338 343 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ACSM1Q08AH1 577 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SREBF2Q12772 1141 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ILKQ13418 452 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SMCO1Q147U7 214 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 P2RY14Q15391 338 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 FKBP1CQ5VVH2 108 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 HBMQ6B0K9 141 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 RAET1GQ6H3X3 334 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 CDC73Q6P1J9 531 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 LINGO4Q6UY18 593 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 TMUB2Q71RG4 321 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 FAM122BQ7Z309 247 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 OAFQ86UD1 273 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 TPRA1Q86W33 373 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PAQR7Q86WK9 346 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PTOV1Q86YD1 416 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 GPR65Q8IYL9 337 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 OR1S1Q8NH92 325 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 NANPQ8TBE9 248 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 RNFT2Q96EX2 444 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 CMTM3Q96MX0 182 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PANX1Q96RD7 426 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 DDOQ99489 341 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 GPR21Q99679 349 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 GINS4Q9BRT9 223 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 NTMT1Q9BV86 223 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 TEX12Q9BXU0 123 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 MROH8Q9H579 483 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 UBR3Q6ZT12 1888 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ALPK3Q96L96 1907 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 A0A0D9SG52 128 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 A0A1B0GTQ1 180 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 GSAPA4D1B5 854 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 ANXA2P2A6NMY6 339 aa3.98□□□□□ -1.77
NANOGP6-201ENST00000429190 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms