RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 CDC25BP30305 580 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 TYRO3Q06418 890 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 SYCP1Q15431 976 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 KAZALD1Q96I82 304 aa19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 TNMDQ9H2S6 317 aa19.94■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP45Q9UL16 551 aa19.94■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 GTF3C6Q969F1 213 aa19.93■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA32Q96LK8 384 aa19.93■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 TAF5LO75529 589 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 GCP02774 474 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 CPA1P15085 419 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 RGS22Q8NE09 1264 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 FAM227BQ96M60 508 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 DCCP43146 1447 aa19.92■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0D9SFI3 127 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 NEURL1BA8MQ27 555 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 NEMFO60524 1076 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 GCKRQ14397 625 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 PDIA6Q15084 440 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 CDC37L1Q7L3B6 337 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 ZMYND15Q9H091 742 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 PROSER3Q2NL68 480 aa19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.9■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 PALLDQ8WX93 1383 aa19.9■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.9■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 ALS2Q96Q42 1657 aa19.9■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.89■□□□□ 0.78
HCLS1-202ENST00000428394 ANXA1P04083 346 aa19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV5-2P06315 115 aa19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 SARM1Q6SZW1 724 aa19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 NECAB1Q8N987 351 aa19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 NEK1Q96PY6 1258 aa19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 GPR108Q9NPR9 543 aa19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.89■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 RESTQ13127 1097 aa19.88■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF790Q6PG37 636 aa19.88■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2G4DQ86XP0 818 aa19.88■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa19.88■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 HAUS7Q99871 368 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 CTIFO43310 598 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 LIG1P18858 919 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 TNNI3KQ59H18 835 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 DACT1Q9NYF0 836 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa19.87■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 PFKFB2O60825 505 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF75DP51815 510 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 FBXL16Q8N461 479 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 DSCC1Q9BVC3 393 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 AGXT2Q9BYV1 514 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 CBX8Q9HC52 389 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 HELLSQ9NRZ9 838 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ERBB3P21860 1342 aa19.86■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 AP5Z1O43299 807 aa19.85■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.85■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ANO6Q4KMQ2 910 aa19.84■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.84■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.84■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 LAMA4Q16363 1823 aa19.83■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 RCOR1Q9UKL0 485 aa19.83■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF609O15014 1411 aa19.83■□□□□ 0.77
HCLS1-202ENST00000428394 SMTNL1A8MU46 457 aa19.83■□□□□ 0.76
HCLS1-202ENST00000428394 H3BQV1 296 aa19.83■□□□□ 0.76
HCLS1-202ENST00000428394 STX1AQ16623 288 aa19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms