RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 POTECB2RU33 542 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 IGKV5-2P06315 115 aa26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.37■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPA6P17066 643 aa26.36■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 TMC4Q7Z404 712 aa26.36■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 FZD9O00144 591 aa26.35■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 JDP2Q8WYK2 163 aa26.35■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.33■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE8AO60658 829 aa26.33■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS33BQ9H267 617 aa26.33■■□□□ 1.81
UBE2E3-201ENST00000392415 COL4A5P29400 1685 aa26.33■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.32■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.32■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 FSTL1Q12841 308 aa26.32■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MPNDQ8N594 471 aa26.32■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.32■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 COL4A1P02462 1669 aa26.3■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SCN4AP35499 1836 aa26.3■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 E9PSI1 815 aa26.3■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PPIP5K2O43314 1243 aa26.29■■□□□ 1.8
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UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.29■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.28■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MYH3P11055 1940 aa26.27■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 H7C1W4 665 aa26.27■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SLFN5Q08AF3 891 aa26.27■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 AOC3Q16853 763 aa26.27■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 GPC2Q8N158 579 aa26.27■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 LINS1Q8NG48 757 aa26.27■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.27■■□□□ 1.8
UBE2E3-201ENST00000392415 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.26■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 GCKRQ14397 625 aa26.26■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.25■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 NIM1KQ8IY84 436 aa26.25■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 CTSWP56202 376 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 F6X3S4 739 aa26.23■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 APLP1P51693 650 aa26.23■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.23■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
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UBE2E3-201ENST00000392415 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.22■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 LTBP1Q14766 1721 aa26.22■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 CASP7P55210 303 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 BEND3Q5T5X7 828 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 HACL1Q9UJ83 578 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 GPSM2P81274 684 aa26.2■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.2■■□□□ 1.79
UBE2E3-201ENST00000392415 RTL9Q8NET4 1388 aa26.2■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.19■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 POLLQ9UGP5 575 aa26.19■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEIP0CG38 1075 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEJP0CG39 1038 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 GREM2Q9H772 168 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHX2P34913 555 aa26.17■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCL9Q07325 125 aa26.17■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 WASHC4Q2M389 1173 aa26.17■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 C6orf229H3BNL8 230 aa26.16■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 CHADLQ6NUI6 762 aa26.16■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 MIER1Q8N108 512 aa26.16■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.16■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 CSF1RP07333 972 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 SCNN1DP51172 638 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 LDHDQ86WU2 507 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 EYA3Q99504 573 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2E3-201ENST00000392415 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.14■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 YDJCA8MPS7 323 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMBP2O15034 1052 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 ALDH1L1O75891 902 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 GGA1Q9UJY5 639 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 SPEF2Q9C093 1822 aa26.12■■□□□ 1.77
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