RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 USP21Q9UK80 565 aa20.88■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF609O15014 1411 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 FSD1Q9BTV5 496 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXO3Q9UK99 471 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 NEK4P51957 841 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM227BQ96M60 508 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 HAUS7Q99871 368 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 SNRKQ9NRH2 765 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 CTSWP56202 376 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 TIMM10P62072 90 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 PTH1RQ03431 593 aa20.84■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 CAMTA2O94983 1202 aa20.83■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.83■□□□□ 0.93
RABGGTA-201ENST00000216840 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A0D9SFI3 127 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 GREM2Q9H772 168 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.82■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1B0GUL7 405 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE8AO60658 829 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 BTAF1O14981 1849 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 BCORQ6W2J9 1755 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 ITGA6P23229 1130 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 MCM2P49736 904 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 RASEFQ8IZ41 740 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 MED23Q9ULK4 1368 aa20.8■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 NHSQ6T4R5 1651 aa20.8■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 SUSD4Q5VX71 490 aa20.8■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.8■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.8■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 HSPA1LP34931 641 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 IL27Q8NEV9 243 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNB2Q92953 911 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 AK7Q96M32 723 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 PARP10Q53GL7 1025 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP4K1Q92918 833 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 TMX3Q96JJ7 454 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 NECTIN1Q15223 517 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 SPEF2Q9C093 1822 aa20.77■□□□□ 0.92
RABGGTA-201ENST00000216840 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.77■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 MCM4P33991 863 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMB2P55268 1798 aa20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 ADORA1P30542 326 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNQ4P56696 695 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 XAGE2Q96GT9 111 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 LRP5O75197 1615 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 AFF2P51816 1311 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.75■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM177BA6PVY3 158 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLIM4O00461 696 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 METTL24Q5JXM2 366 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 SBF2Q86WG5 1849 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 TTC14Q96N46 770 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 NTSR2O95665 410 aa20.73■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CHGBP05060 677 aa20.73■□□□□ 0.91
RABGGTA-201ENST00000216840 CUL4AQ13619 759 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.7 ms