RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077853.4

Prpf4b-201, Transcript of Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf4b, Length 7,844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 IqcgQ80W32 419 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Terf2ipQ91VL8 393 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rdm1Q9CQK3 281 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 AmfrQ9R049 643 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmx1Q8VBT0 278 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lrrfip2Q91WK0 415 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Speer4aF8VPX6 267 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mdm2P23804 489 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pip4k2bQ80XI4 416 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 GckrQ91X44 587 aa10.01□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ms4a1P19437 291 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cers3Q1A3B0 383 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Kmt5bQ3U8K7 883 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 ClasrpQ8CFC7 668 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ctage5Q8R311 779 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Chrna2Q91X60 512 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ercc3P49135 783 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Hdhd2Q3UGR5 259 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ppm1fQ8CGA0 452 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cetn2Q9R1K9 172 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 AU022751B1B0V2 589 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Grm8P47743 908 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 RalylQ8BTF8 293 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam114a1Q9D281 569 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 WtapQ9ER69 396 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Trak2Q6P9N8 913 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Egfl6Q9JJZ5 550 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Setdb1O88974 1307 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cnnm2Q3TWN3 875 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Map3k11Q80XI6 850 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vps37dQ810I0 261 aa10□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Znf568E9PYI1 671 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Iffo1Q8BXL9 562 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Abcc6Q9R1S7 1498 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cnpy2Q9QXT0 182 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Atp1a4Q9WV27 1032 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Astn2Q80Z10 1352 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ccdc82Q6PG04 518 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Plcd1Q8R3B1 756 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pla2r1Q62028 1487 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Bicdl1A0JNT9 577 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 1700006A11RikB9EHI3 544 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 NpcdF8VQB8 469 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Bach2P97303 839 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Stk36Q69ZM6 1316 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 PxdnQ3UQ28 1475 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pnpla2Q8BJ56 486 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 PalldQ9ET54 1408 aa9.99□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sun3Q5SS91 320 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Acbd3Q8BMP6 525 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tsr2Q8C8T8 191 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam107bQ3TGF2 131 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gys2Q8VCB3 704 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zbtb43Q9DAI4 467 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rassf4Q8CB96 322 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Aox1O54754 1333 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zscan22Q8BGS5 496 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam177a1Q8BR63 207 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Skor1Q8BX46 964 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 DymQ8CHY3 669 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zscan25B2RX31 543 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Leo1Q5XJE5 667 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem132eQ6IEE6 982 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Atg4aQ8C9S8 396 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Syce1Q9D495 329 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Izumo3A6PWV3 263 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ccdc122Q8BVN0 290 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Triml1Q8BVP1 470 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Q9D5Q8 446 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Nphp4P59240 1425 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Speer4dL7N216 212 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Myo1bP46735 1107 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vps37cQ8R105 352 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem132aQ922P8 1018 aa9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa9.97□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gramd4Q8CB44 633 aa9.97□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Bmp2kQ91Z96 1138 aa9.97□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Aifm3Q3TY86 605 aa9.97□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ctdp1Q7TSG2 960 aa9.97□□□□□ -0.81
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 131.2 ms