RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf21Q9H246 121 aa2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR76Q9H967 626 aa2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNG12Q9UBI6 72 aa2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF11Q9UIL8 331 aa2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa2.53□□□□□ -2
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3TC1Q8TE82 1336 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PQ67 120 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSAPA4D1B5 854 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G3V4G9 280 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCGB2A1O75556 95 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEBLO76041 1014 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNNI3P19429 210 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP6V1B2P21281 511 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HPCAL1P37235 193 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR2DS4P43632 304 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP3M2P53677 418 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSD17B7P56937 341 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1328Q86T90 577 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RDH10Q8IZV5 341 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC43Q8N309 656 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10G3Q8NGC4 313 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6C4Q8NGE1 309 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10A7Q8NGE5 316 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF596Q8TC21 504 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GIMAP1Q8WWP7 306 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAPGEF5Q92565 580 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARPC1AQ92747 370 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT23Q9C075 422 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEAF6Q9HAF1 191 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBK1Q9UHD2 729 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASD1Q9Y272 281 aa2.52□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPRASP1Q5JY77 1395 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0G2JN53 185 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PNV4 684 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCTN6O00399 190 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAD1O00515 517 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1F1O43749 312 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GIPP09681 153 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF823P16415 610 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXCR2P25025 360 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HTR2AP28223 471 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXA9P31269 272 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAP3P51398 398 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLX1P56177 255 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL1RL1Q01638 556 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIPK1Q13546 671 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSG5Q15238 335 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM16LQ309B1 348 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIGGQ5H8A4 983 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GDPD3Q7L5L3 318 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf120Q7Z4R8 191 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM3CQ92520 227 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTRCQ99895 268 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPK1Q9H3S4 243 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC4Q9Y296 219 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WZY1 265 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GUS0 222 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C11orf94C9JXX5 98 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN12O43309 604 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXCL13O43927 109 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RETP07949 1114 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDGF1P13385 188 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YWHABP31946 246 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LONP1P36776 959 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS9P46781 194 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFPI2P48307 235 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDGF1P3P51864 188 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF136P52737 540 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MOBPQ13875 183 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGTA1PQ4G0N0 100 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52W1Q6IF63 320 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FTMTQ8N4E7 242 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHRSXQ8N5I4 330 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4D9Q8NGE8 314 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF721Q8TF20 911 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4orf36Q96KX1 117 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP170P1Q96L14 293 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FCRL1Q96LA6 429 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOPNLQ96NB1 174 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 P2RY13Q9BPV8 354 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa2.5□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms