RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376350.7

PTPRH-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,877 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-202ENST00000376350 A3GALT2U3KPV4 340 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PLXNA2O75051 1894 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 HPGDSO60760 199 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 CCKBRP32239 447 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ST3GAL3Q11203 375 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 IDNKQ5T6J7 187 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 KLBQ86Z14 1044 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 CYR61O00622 381 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZGLP1P0C6A0 271 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 BIKQ13323 160 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 KIF26BQ2KJY2 2108 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ELOA3BQ3SY89 546 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 GXYLT1Q4G148 440 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 Q8N402 240 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ELOA3Q8NG57 546 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 DTX4Q9Y2E6 619 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PRG2P13727 222 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 MANEAQ5SRI9 462 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 KRT74Q7RTS7 529 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 NEIL3Q8TAT5 605 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 IFT27Q9BW83 186 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 VN1R1Q9GZP7 353 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 LOXL2Q9Y4K0 774 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 USP34Q70CQ2 3546 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 A0A087WUU8 490 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 OR6A2O95222 327 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 SLC2A10O95528 541 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PRKAR1AP10644 381 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 SDHBP21912 280 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 LIMS1P48059 325 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 EPHA4P54764 986 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ENTPD8Q5MY95 495 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 DCAF12Q5T6F0 453 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 OGFOD3Q6PK18 319 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 IL20RBQ6UXL0 311 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 DIO2Q92813 273 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 FRMD6Q96NE9 622 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PCDH15Q96QU1 1955 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 A0A1W2PPK0 400 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PEPDP12955 493 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF79Q15937 498 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 EIPR1Q53HC9 387 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 LCN1P1Q5VSP4 162 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 CNIH2Q6PI25 160 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZAR1Q86SH2 424 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 UBQLNLQ8IYU4 475 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 SLC2A12Q8TD20 617 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PIGUQ9H490 435 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 MED20Q9H944 212 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PRDM9Q9NQV7 894 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 APC2O95996 2303 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 HIST1H2ABP04908 130 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 HSD17B7P56937 341 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 IFITM2Q01629 132 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ALG10BQ5I7T1 473 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF619Q8N2I2 560 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 AP3S1Q92572 193 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 HIST1H2ACQ93077 130 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 TM4SF19Q96DZ7 209 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 DPH1Q9BZG8 443 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 RPS15P62841 145 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 PRTGQ2VWP7 1150 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRH-202ENST00000376350 NKAIN4Q8IVV8 208 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141 ms