RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ACPT	Q9BZG2	426 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP7	Q9Y680	259 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		9.54	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC151	A5D8V7	595 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5H1	A6NKK0	313 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT19	A8MXV4	375 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C417	338 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF195	O14628	629 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD51D	O75771	328 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6H	O94772	140 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT7L	O94864	414 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-16	P01601	117 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPS2	P11908	318 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPP1	P22413	925 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PTAFR	P25105	342 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ELK4	P28324	431 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SHC1	P29353	583 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	OR3A2	P47893	321 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CAV1	Q03135	178 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	SPOCK1	Q08629	439 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB3	Q12988	150 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	IMPG1	Q17R60	797 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF544	Q6NX49	715 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	9.53	□□□□□ -0.88	5e-6	■■■■■ 56.5
SKAP2-209	ENST00000497511	POC1B	Q8TC44	478 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP5K	Q9BT40	448 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	MYNN	Q9NPC7	610 aa		9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	9.53	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511	CAD	P27708	2225 aa		9.52	□□□□□ -0.88
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PR80	420 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MT66	165 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NPHS1	O60500	1241 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMG1	O95456	288 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA2	P17301	1181 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-2	P23083	117 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CD40	P25942	277 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CFP	P27918	469 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PHB	P35232	272 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PRIM2	P49643	509 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG11	P61952	73 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MLC1	Q15049	377 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CR1L	Q2VPA4	569 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM110B	Q8TC76	370 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP90	Q8TF47	636 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	JADE3	Q92613	823 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL8A	Q96BM9	186 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FKRP	Q9H9S5	495 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GCM1	Q9NP62	436 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		9.52	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511		B2RBV5	119 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BNH8	94 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFS8	O00217	210 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS14	O43566	566 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-9	P01782	118 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NGFR	P08138	427 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	INHBA	P08476	426 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	DBH	P09172	617 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	LINGO3	P0C6S8	592 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TAC1	P20366	129 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1C1	P21283	382 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B3	P37058	310 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NR4A2	P43354	598 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR6	P50406	440 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00310	P59036	64 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	COX18	Q8N8Q8	333 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO17	Q96EF6	278 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf159	Q96HA4	380 aa		9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	9.51	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PSD2	Q9BQI7	771 aa		9.51	□□□□□ -0.89

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