RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495355.1

YIPF4-204, Transcript of Yip1 domain family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene YIPF4, Length 544 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4-204ENST00000495355 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.97■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 PARD6BQ9BYG5 372 aa15.97■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 FANCFQ9NPI8 374 aa15.97■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.97■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 DPRXA6NFQ7 191 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 OVOL3O00110 214 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 HMGN4O00479 90 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 TM9SF1O15321 606 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 LYZL6O75951 148 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 FESP07332 822 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 COX5AP20674 150 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 UQCRC2P22695 453 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 IL32P24001 234 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 MERTKQ12866 999 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 ITGADQ13349 1161 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 SYT14P1Q58G82 188 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 TMPPEQ6ZT21 453 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 ROPN1LQ96C74 230 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 ARL5BQ96KC2 179 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 NPAP1Q9NZP6 1156 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 WDR45Q9Y484 360 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.96■□□□□ 0.15
YIPF4-204ENST00000495355 ZNF716A6NP11 495 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 ZNF724A8MTY0 619 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 SDHDO14521 159 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 RAMP1O60894 148 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 THBS1P07996 1170 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 LBPP18428 481 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 PGCP20142 388 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 IGHV1-2P23083 117 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CDKN2CP42773 168 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 UFM1P61960 85 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CHRNEQ04844 493 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 BSPH1Q075Z2 132 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 BST1Q10588 318 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 P2RY6Q15077 328 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 OGFOD2Q6N063 350 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 HSD17B8Q92506 261 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CCDC115Q96NT0 180 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 EXD2Q9NVH0 621 aa15.95■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 HIVEP2P31629 2446 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 E9PBE3 544 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 AP3D1O14617 1153 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 NME5P56597 212 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 MAPK11Q15759 364 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 PGGHGQ32M88 737 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 ANXA8L1Q5VT79 327 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 ADGRG3Q86Y34 549 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 LRRC34Q8IZ02 419 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 ANKFN1Q8N957 763 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 INPP5KQ9BT40 448 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 TRIM2Q9C040 744 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 OR11A1Q9GZK7 315 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 SLC38A1Q9H2H9 487 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 POLE3Q9NRF9 147 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 AIG1Q9NVV5 245 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CR1P17927 2039 aa15.94■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CLOCKO15516 846 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 TMCC2O75069 709 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CHRM4P08173 479 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 RYKP34925 604 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 KHKP50053 298 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 ATP5J2P56134 94 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 WDR4P57081 412 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 TNK1Q13470 666 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 SYPL1Q16563 259 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 RNF130Q86XS8 419 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 TMEM234Q8WY98 164 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CXorf56Q9H5V9 222 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.93■□□□□ 0.14
YIPF4-204ENST00000495355 BTNL2Q9UIR0 455 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms